Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K8

Slc25a39, Solute carrier family 25 member 39, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a39Q9D8K8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a39Q9D8K8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a39Q9D8K8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a39Q9D8K8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc25a39Q9D8K8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc25a39Q9D8K8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc25a39Q9D8K8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms