Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp4bQ9D8B3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4bQ9D8B3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Chmp4bQ9D8B3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp4bQ9D8B3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms