Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ndufb8Q9D6J5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms