Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc83Q9D4V3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms