Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms