Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms