Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul2Q9D4H8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul2Q9D4H8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul2Q9D4H8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms