Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933425L06RikQ9D3Z8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4933425L06RikQ9D3Z8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms