Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rufy3Q9D394 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy3Q9D394 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy3Q9D394 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms