Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rasgef1cQ9D300 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgef1cQ9D300 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgef1cQ9D300 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgef1cQ9D300 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms