Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ToporslQ9D2F8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ToporslQ9D2F8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ToporslQ9D2F8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ToporslQ9D2F8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ToporslQ9D2F8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ToporslQ9D2F8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ToporslQ9D2F8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms