Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l4Q9D2A5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Creb3l4Q9D2A5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Creb3l4Q9D2A5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms