Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal2bQ9D1Y9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms