Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem88Q9D0N8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem88Q9D0N8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms