Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spc24Q9D083 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spc24Q9D083 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms