Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab3bQ9CZT8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab3bQ9CZT8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172 ms