Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc18Q9CZJ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dnajc18Q9CZJ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.7 ms