Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc77Q9CZH8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc77Q9CZH8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc77Q9CZH8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc77Q9CZH8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc77Q9CZH8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc77Q9CZH8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc77Q9CZH8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc77Q9CZH8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc77Q9CZH8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc77Q9CZH8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms