Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snx7Q9CY18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx7Q9CY18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx7Q9CY18 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms