Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ist1Q9CX00 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ist1Q9CX00 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ist1Q9CX00 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms