Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn1Q9CWM4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pfdn1Q9CWM4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn1Q9CWM4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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