Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NubplQ9CWD8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms