Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Nrxn1Q9CS84 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrxn1Q9CS84 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn1Q9CS84 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn1Q9CS84 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms