Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gkn1Q9CR36 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gkn1Q9CR36 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gkn1Q9CR36 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms