Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pop4Q9CR08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pop4Q9CR08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pop4Q9CR08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms