Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PompQ9CQT5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PompQ9CQT5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PompQ9CQT5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms