Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab5aQ9CQD1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms