Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sar1bQ9CQC9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sar1bQ9CQC9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sar1bQ9CQC9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms