Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpa3Q9CQ71 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpa3Q9CQ71 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpa3Q9CQ71 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms