Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms