Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp3Q9CQ10 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chmp3Q9CQ10 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp3Q9CQ10 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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