Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt23Q99PS0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt23Q99PS0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt23Q99PS0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt23Q99PS0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms