Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab27bQ99P58 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab27bQ99P58 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms