Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a6cQ99N08 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a6cQ99N08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms