Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tlr3Q99MB1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr3Q99MB1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlr3Q99MB1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms