Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Chmp1b1Q99LU0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Chmp1b1Q99LU0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp1b1Q99LU0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp1b1Q99LU0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp1b1Q99LU0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp1b1Q99LU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp1b1Q99LU0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp1b1Q99LU0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms