Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pagr1aQ99L02 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pagr1aQ99L02 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pagr1aQ99L02 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1aQ99L02 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms