Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf19Q99KP6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf19Q99KP6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prpf19Q99KP6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms