Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clint1Q99KN9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clint1Q99KN9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms