Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacsin3Q99JB8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacsin3Q99JB8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacsin3Q99JB8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.7 ms