Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim11aQ99J19 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smim11aQ99J19 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim11aQ99J19 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms