Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nrif1Q923B3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nrif1Q923B3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrif1Q923B3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms