Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Riok1Q922Q2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Riok1Q922Q2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms