Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Clip1Q922J3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Clip1Q922J3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Clip1Q922J3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Clip1Q922J3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Clip1Q922J3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms