Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atl3Q91YH5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atl3Q91YH5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atl3Q91YH5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms