Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx9Q91VH2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snx9Q91VH2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx9Q91VH2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms