Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraipQ8VIG6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraipQ8VIG6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms