Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdlbpQ8VDJ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HdlbpQ8VDJ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HdlbpQ8VDJ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HdlbpQ8VDJ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms