Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SdsQ8VBT2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SdsQ8VBT2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SdsQ8VBT2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SdsQ8VBT2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms