Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top1mtQ8R4U6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top1mtQ8R4U6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1mtQ8R4U6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top1mtQ8R4U6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms